《青衣》这部电影讲述的是一段发生在清末的纨绔子弟与戏子的故事，集合了爱情、友情、国仇家恨、民族大义、禁断、凄美、虐心、粉红、狗血于一身。剧本故事是这样的：清朝末年，朝廷腐败，国库虚空，随着大航海时代来临，西洋人纷纷涌入中国，西方文化科技与闭关锁国已久的古老东方国家激烈碰撞，迸溅出璀璨的火花。沿海地区是最先受到新鲜信息与科技文化差距冲击的地方，而稍微远些的天子脚下的京城，则依然如故，王官贵人纸醉金迷的生活并未改变。
  在京城，无人不知无人不晓天下第一戏班里最为有名的戏子卢青。据说卢青出身贫寒，原先是戏班里的一个马夫的私生子，母亲不知道是谁，据传是名青楼女子。生了卢青出来后，那青楼名妓不肯认这个儿子，而马夫在不久后亦生了场大病，在某个雨夜就去了。戏班本来就不算富裕，每个人都要干活才能吃饭，但是戏班主人看着嗷嗷待哺的卢青，终于还是于心不忍，就把他养了下来，准备以后当个杂役。没想到在养大的过程中，意外发现卢青很有唱戏的天赋，身段好、唱腔佳，传闻他虽为男子，却美艳堪比女子，勾人心魄，却也为人清高，桀骜不训。许多王公贵族都会去捧他的场，一砸千金，就为了博取高傲的卢青赏脸一起喝个小酒。只是卢青因为生母的原因，痛恨任何不干不净的皮肉营生——换言之，就是不少人想潜他，但是他不让潜。
  纪屿是京城中出了名的纨绔子弟，家中世代为商，根基颇深。纪屿为人风流多情，平素最爱美人，尤其是那种高傲的美人，就更能勾起他的征服欲。某次，他与朋友一起去戏班听戏，虽然朋友包了场，但是纪屿从来都无心戏曲，这次来只不过是卖个面子给朋友。从戏班表演一开始，纪屿就没怎么正眼看过舞台，只在下面与莺莺燕燕调情。但当卢青压轴上场的时候，纪屿却被他的艳丽和凛然深深吸引，甚至为之神魂颠倒，在结束后依然久久回不了神，看见那种摧毁一切的美丽后，瞬间就觉得身边的美丽侍女变成了胭脂俗粉。但卢青的名头他也不是没有听过，稍微一打听就知道这个小戏子很难潜。虽然说强来也不是不行，但总归是少了点征服的乐趣。于是，纪屿为了得到卢青，采用了一些手段去伪装自己，让卢青放下戒备，逐渐攻克了他的心防。可是哪怕如此，卢青也不愿意辞去戏班的营生跟纪屿回府，而纪屿则潜意识里依然把“带卢青回府”作为征服卢青的终极目标，彼此胶着，谁也不愿意退一步，这是影片中最欢乐的一段，两人互相斗智斗勇，纪屿想尽办法，还悄悄在背后向戏班老板施压，还是没办法撼动卢青。卢青反倒提出要纪屿跟着他离开，最终，纪屿为了得到美人而妥协了，反倒跟着卢青去山林里生活——纪屿父亲早逝，管不了他。纪家大哥气得吹胡子瞪眼，但是拿自己任性的弟弟没办法，加之族内生意忙碌，没空去管纪屿。但实际上，他也觉得没必要去管，以过往的经验看，只要纪屿厌倦了，自然就会回来。就这样，纪屿和卢青过起了简单的田园生活。
  不到三个月，纪屿就开始坐不住了，这里远离人烟，他终究纨绔了十多年，耐不住寂寞，就常常偷偷溜去山下听曲儿，甚至找点莺莺燕燕喝个酒看个歌舞。然而不管纪屿做了什么，卢青从来都不问不疑，不吵不闹，只静静地做自己的事情，种花、泡茶，自得其乐。某个傍晚，纪屿下山，半路下雨，他匆匆走进酒馆，却遇到了他曾经的纨绔朋友，那朋友喝醉了酒，笑嘻嘻地跟纪屿扯皮，说着说着，就说到现在京城都知道纪家小儿子为了个卖屁股的戏子跑上山，宁愿去侍奉男人也不回家。那个年代的戏子的身份是很低下的，纪屿气疯了，当场就大声说自己和卢青早就没关系了。不料身后酒馆的门忽然开了，卢青看见下雨了就来送伞，刚好碰上了这剑拔弩张的场景。一群纨绔子弟哄笑着，仿佛在说——瞧，刚才还说没关系呢，这下子就来送伞了。卢青不明所以，但看到沉默的纪屿和其他人的表情，也知道发生了什么事，就上前两步，第一次在众人面前拉起了纪屿的手，表现出了明显的保护之意，低声说：“我们回去。”下一秒，纪屿猛地甩开了他的手，“别碰我！”四周哄堂大笑，纪屿生平第一次觉得自己面子都丢光了，脸上火辣辣的……没错，这是个戏子，只是个戏子啊……
  被纪屿下意识地甩开了，卢青沉默着，什么也没说，只把伞递给了纪屿，纪屿一甩手，把伞扔在地上，让卢青赶快滚。卢青看了他一眼，匆匆消失在雨幕里了。等雨停了，纪屿才觉得自己过分了，连忙上山，家里乌灯黑火的，一阵莫名的心慌笼罩住了他，纪屿几乎是一脚深一脚浅地冲了上去，砰地打开门，卢青还在屋里，没开灯，静静地坐在床边发呆。那天晚上，卢青就和纪屿说：你也很久没回过家了，我也想回家乡一段时间，探一下亲。
  纪屿嘴唇动了动，没反对——卢青那双眼睛清澈而平静，或许他早就知道了自己的焦躁，对这种有别于过往，凡事需要亲力亲为，一下子从高处空落下来的生活的焦躁。
  第二天，天蒙蒙亮，卢青起身后，给纪屿掖了掖被子。纪屿整天晚上都没睡着，但是这个时刻，他却装作熟睡的样子，不敢转身。卢青一如既往地起身蒸了点包子，喂了鸡舍里的几只鸡。出发前，他站在床边，似乎想对纪屿说什么，最终只是轻轻叹了一口气，摸了摸纪屿的头发，就背起一个小包袱上路了，那姿态，就好像只是离开半天去一下市集而已。
  但是纪屿就是知道，卢青不会再回来了。他不打算挽留，或者甚至可以说是莫名其妙地松了一口气。
  日上枝头，他终于也起身，把几只鸡放了，离开了这里。回到纪家，从前的生活又回来了，一开始很满足。但过了半年，他开始总觉得现在差了点什么。周围的人确实一如既往地很殷勤，但他却开始想念山上的小菜园。对卢青的感觉从愧疚变成了淡淡的怨怼和深深的委屈——为什么，为什么那天晚上不质问我，而是直接丢下我了？如果那天晚上，卢青开口骂他，或者说点什么别的，他也许就会顺势留下卢青……他只是觉得无地自容，所以恼羞成怒发了火，发了火又难以开口，又的确是愤懑不平——是啊，那不过是个戏子，他却为了个戏子蒙受前二十年从未蒙受过的嘲笑。他的自尊心不允许自己在那种情境下拉住卢青。再加上对生活有些厌倦，所以没有开口挽留。而现在他发现，如果卢青还会回来的话，哪怕下次再有别的人说坏话，他也不会理会了。
  那个月，局势开始越发动荡，许多商人计划着移居海外，躲避战乱。纪家也有这个打算，纪屿却一直没有松口说走。
  也是从那段时间开始，他就神差鬼使地隔一段时间就上山走走，以前住过的木屋却一直都没有升起过炊烟。直到某日，他看到山上有一股炊烟袅袅升起，心中燃起意外的强烈的狂喜，震颤他的心灵——卢青回来了！他不顾一切地跑到了山上，却发现是旅人借住了那木屋而已，屋内摆设都未变，但是那个在那里自得其乐地照顾小菜园的人已经不在了。
  纪屿怔怔地看着，心痛难当。翌日就快马加鞭去了卢青家乡，找到了卢青。一年未见，卢青对他态度依旧，他受宠若惊，坐了下来。没想到他还没开口邀请卢青和他一起离开即将被战火波及的中国，卢青就已经先一步和他辞行，说自己这一年打算去别的地方教书，战火不可避免，他能做的就是留在自己的根上，和千千万万的人们一起，为民族尽一份微薄的力量。纪屿想劝说的话全堵在了嗓子里，卢青眉眼清亮，无需多言。此时的他，和当初戏班里那个他似乎有所不同，但本质却又像是没改变过。
  送纪屿出门的时候，纪屿堵在嗓子里的话终于说出口了。卢青看着他说，我早就发现了——真心喜欢一个人的时候，不在于能和他共度精彩的时光，而在于能把一辈子乏味的生活过得有滋有味。我知道自己是个戏子，但我凭自己的努力去吃饭，从来没有瞧不起自己过，别的人怎么看我，我从来都不在乎，唯独你对我的轻蔑和瞧不起，我会在乎。我知道你现在想通了。那时候我心里最重要的事情，是经营好和你的小家。但是这一年来，我不只是留在这里，我走过了很多地方，对以前的事渐渐淡了——现在，我已经找到了更值得做的事情。
  纪屿红着眼睛看着卢青，嘴唇颤抖。卢青想起了以前两个人在一起时纪屿随口说的东西，就笑笑说：阿屿，你以前说过对外国的生活很好奇，还说想去外国学点东西，我祝你在外国一切顺利。希望我们下次再见的时候，中国已经和平安定下来，那时候我会好好听你说外国的见闻的。一切珍重。
  ——谁都知道这句话只是客套，今日一分别，就是永别了。他日茫茫人海，生死未卜，说不定某天就死在哪里了。神州辽阔大地，战火阻隔通讯，除非出现奇迹，不然又怎么可能再见呢？
  最后，卢青抱了抱纪屿，平静地朝他挥手，然后缓缓关门。三日后，卢青动身离开家乡。一个月后，纪家举家搬迁，纪屿浑浑噩噩地登了船。站在船尾，他摸了摸口袋，那里还有一包卢青那日送给他的蜜饯。他食不知味地吃着，豆大的眼泪忽然就涌出来，他跪在船尾，泣不成声。
  而巨大的轮船，已经载着他离开大陆，缓缓驶向未知的远方——那个他和卢青憧憬过的地方。
  分离，不知道未来是否会重逢，这个开放式的结局，就是整套影片的结局。